Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC107Q8WV48 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms