Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms