Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3RF3Q8TEJ3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms