Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH3Q8TE77 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
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