Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELBQ8NG08 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms