Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC9Q8NEP7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms