Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3C3Q8NEB9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms