Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms