Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HJURPQ8NCD3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HJURPQ8NCD3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms