Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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