Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POMGNT2Q8NAT1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POMGNT2Q8NAT1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms