Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5D6

GBGT1, Globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBGT1Q8N5D6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBGT1Q8N5D6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBGT1Q8N5D6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms