Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms