Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLIP4Q8N3C7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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