Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms