Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTU1Q7Z7A3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTU1Q7Z7A3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms