Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms