Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC8DQ7L1W4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms