Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms