Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNE3Q6ZMZ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms