Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC36A4Q6YBV0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms