Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms