Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALKBH2Q6NS38 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALKBH2Q6NS38 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms