Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms