Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf60Q5U649 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf60Q5U649 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf60Q5U649 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf60Q5U649 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf60Q5U649 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf60Q5U649 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf60Q5U649 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf60Q5U649 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf60Q5U649 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms