Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms