Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF648Q5T619 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms