Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO47Q5MNV8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms