Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HABP4Q5JVS0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms