Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITRM1Q5JRX3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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