Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOM1Q5C9Z4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms