Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms