Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms