Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF6Q58WW2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF6Q58WW2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms