Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms