Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTBL2Q562R1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms