Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COBLL1Q53SF7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms