Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms