Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms