Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC38Q502W7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC38Q502W7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms