Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVEP1Q4LDE5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVEP1Q4LDE5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms