Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP13-3Q3SY46 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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