Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms