Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC96Q2M329 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms