Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms