Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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