Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FSCN1Q16658 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN1Q16658 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms