Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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