Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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