Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
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